Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG1

APPL1, DCC-interacting protein 13-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPL1Q9UKG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
APPL1Q9UKG1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
APPL1Q9UKG1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APPL1Q9UKG1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APPL1Q9UKG1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms