Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
USP21Q9UK80 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
USP21Q9UK80 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
USP21Q9UK80 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
USP21Q9UK80 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
USP21Q9UK80 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.82■■■■□ 3
USP21Q9UK80 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.82■■■■□ 3
USP21Q9UK80 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
USP21Q9UK80 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
USP21Q9UK80 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP21Q9UK80 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP21Q9UK80 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
USP21Q9UK80 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
USP21Q9UK80 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
USP21Q9UK80 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
USP21Q9UK80 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP21Q9UK80 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
USP21Q9UK80 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
USP21Q9UK80 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
USP21Q9UK80 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms