Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNA1Q9UIW2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLXNA1Q9UIW2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PLXNA1Q9UIW2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PLXNA1Q9UIW2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PLXNA1Q9UIW2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms