Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CPA4Q9UI42 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CPA4Q9UI42 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CPA4Q9UI42 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
CPA4Q9UI42 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 529.1 ms