Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCSK1NQ9UHG2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCSK1NQ9UHG2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PCSK1NQ9UHG2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PCSK1NQ9UHG2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCSK1NQ9UHG2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms