Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EBF1Q9UH73 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EBF1Q9UH73 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EBF1Q9UH73 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EBF1Q9UH73 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms