Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SRRDQ9UH36 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SRRDQ9UH36 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SRRDQ9UH36 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SRRDQ9UH36 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms