Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NIPSNAP3AQ9UFN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NIPSNAP3AQ9UFN0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms