Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
DKK4Q9UBT3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DKK4Q9UBT3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DKK4Q9UBT3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK4Q9UBT3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 471.7 ms