Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
XPR1Q9UBH6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
XPR1Q9UBH6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
XPR1Q9UBH6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
XPR1Q9UBH6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms