Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD5

ORC3, Origin recognition complex subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ORC3Q9UBD5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ORC3Q9UBD5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ORC3Q9UBD5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ORC3Q9UBD5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
ORC3Q9UBD5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ORC3Q9UBD5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ORC3Q9UBD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ORC3Q9UBD5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ORC3Q9UBD5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ORC3Q9UBD5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ORC3Q9UBD5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
ORC3Q9UBD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms