Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEMA5BQ9P283 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEMA5BQ9P283 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEMA5BQ9P283 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEMA5BQ9P283 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms