Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLRT3Q9NZU0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FLRT3Q9NZU0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FLRT3Q9NZU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms