Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
UBP1Q9NZI7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBP1Q9NZI7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBP1Q9NZI7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBP1Q9NZI7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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