Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ZDHHC3Q9NYG2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZDHHC3Q9NYG2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZDHHC3Q9NYG2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms