Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVV0

TMEM38B, Trimeric intracellular cation channel type B, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38BQ9NVV0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38BQ9NVV0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM38BQ9NVV0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM38BQ9NVV0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM38BQ9NVV0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM38BQ9NVV0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms