Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVS2

MRPS18A, 39S ribosomal protein S18a, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS18AQ9NVS2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPS18AQ9NVS2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS18AQ9NVS2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS18AQ9NVS2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms