Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
LTBP3Q9NS15 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
LTBP3Q9NS15 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
LTBP3Q9NS15 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
LTBP3Q9NS15 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
LTBP3Q9NS15 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
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