Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBQLN4Q9NRR5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBQLN4Q9NRR5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBQLN4Q9NRR5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBQLN4Q9NRR5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms