Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHST11Q9NPF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHST11Q9NPF2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHST11Q9NPF2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CHST11Q9NPF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CHST11Q9NPF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms