Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB3

CABP2, Calcium-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP2Q9NPB3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CABP2Q9NPB3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CABP2Q9NPB3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
CABP2Q9NPB3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
CABP2Q9NPB3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.71■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CABP2Q9NPB3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
CABP2Q9NPB3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CABP2Q9NPB3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CABP2Q9NPB3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CABP2Q9NPB3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CABP2Q9NPB3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CABP2Q9NPB3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms