Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALMDQ9NP74 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PALMDQ9NP74 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALMDQ9NP74 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PALMDQ9NP74 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms