Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HMG20AQ9NP66 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HMG20AQ9NP66 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HMG20AQ9NP66 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HMG20AQ9NP66 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms