Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BRMS1Q9HCU9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRMS1Q9HCU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRMS1Q9HCU9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRMS1Q9HCU9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRMS1Q9HCU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms