Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC9

ZFYVE28, Lateral signaling target protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFYVE28Q9HCC9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ZFYVE28Q9HCC9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
ZFYVE28Q9HCC9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
ZFYVE28Q9HCC9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
ZFYVE28Q9HCC9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ZFYVE28Q9HCC9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZFYVE28Q9HCC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZFYVE28Q9HCC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZFYVE28Q9HCC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ZFYVE28Q9HCC9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms