Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLK4Q9HAZ1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLK4Q9HAZ1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLK4Q9HAZ1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms