Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S5

FKRP, Fukutin-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FKRPQ9H9S5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FKRPQ9H9S5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
FKRPQ9H9S5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FKRPQ9H9S5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FKRPQ9H9S5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms