Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVMER34-1Q9H9K5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVMER34-1Q9H9K5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ERVMER34-1Q9H9K5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERVMER34-1Q9H9K5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms