Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COG4Q9H9E3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COG4Q9H9E3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COG4Q9H9E3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COG4Q9H9E3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms