Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM38AQ9H6F2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM38AQ9H6F2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM38AQ9H6F2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM38AQ9H6F2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms