Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRDM12Q9H4Q4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRDM12Q9H4Q4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms