Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L7

SMARCAD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCAD1Q9H4L7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMARCAD1Q9H4L7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMARCAD1Q9H4L7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SMARCAD1Q9H4L7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMARCAD1Q9H4L7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SMARCAD1Q9H4L7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms