Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SEMA6AQ9H2E6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA6AQ9H2E6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA6AQ9H2E6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SEMA6AQ9H2E6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SEMA6AQ9H2E6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms