Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1Y3

OPN3, Opsin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3Q9H1Y3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OPN3Q9H1Y3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OPN3Q9H1Y3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
OPN3Q9H1Y3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
OPN3Q9H1Y3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms