Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBM38Q9H0Z9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBM38Q9H0Z9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RBM38Q9H0Z9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RBM38Q9H0Z9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RBM38Q9H0Z9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 454.8 ms