Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
NIF3L1Q9GZT8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NIF3L1Q9GZT8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NIF3L1Q9GZT8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NIF3L1Q9GZT8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms