Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SENP6Q9GZR1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SENP6Q9GZR1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SENP6Q9GZR1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SENP6Q9GZR1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms