Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRIM31Q9BZY9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TRIM31Q9BZY9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TRIM31Q9BZY9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TRIM31Q9BZY9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms