Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ76

CNTNAP3, Contactin-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP3Q9BZ76 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CNTNAP3Q9BZ76 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNTNAP3Q9BZ76 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CNTNAP3Q9BZ76 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms