Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LRRC3Q9BY71 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LRRC3Q9BY71 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LRRC3Q9BY71 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LRRC3Q9BY71 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms