Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CDCA4Q9BXL8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDCA4Q9BXL8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDCA4Q9BXL8 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDCA4Q9BXL8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms