Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TMEM106CQ9BVX2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TMEM106CQ9BVX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TMEM106CQ9BVX2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TMEM106CQ9BVX2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TMEM106CQ9BVX2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms