Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF7

CRB3, Protein crumbs homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB3Q9BUF7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB3Q9BUF7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB3Q9BUF7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB3Q9BUF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB3Q9BUF7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB3Q9BUF7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRB3Q9BUF7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CRB3Q9BUF7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRB3Q9BUF7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRB3Q9BUF7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CRB3Q9BUF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms