Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MED18Q9BUE0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MED18Q9BUE0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MED18Q9BUE0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MED18Q9BUE0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms