Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFJQ9BTM1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2AFJQ9BTM1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFJQ9BTM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFJQ9BTM1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms