Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CHCHD5Q9BSY4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CHCHD5Q9BSY4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CHCHD5Q9BSY4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms