Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRR3

TMEM246, Transmembrane protein 246, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM246Q9BRR3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM246Q9BRR3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM246Q9BRR3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM246Q9BRR3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM246Q9BRR3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms