Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACBD6Q9BR61 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACBD6Q9BR61 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ACBD6Q9BR61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACBD6Q9BR61 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ACBD6Q9BR61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms