Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PMCHL2Q9BQD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PMCHL2Q9BQD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PMCHL2Q9BQD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms