Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SPOCK3Q9BQ16 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SPOCK3Q9BQ16 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SPOCK3Q9BQ16 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms